大规模投入使用――最早的飞弹战 V-1投产后，德军便开始加紧修建飞弹发射阵地，多数飞弹阵地集中在距法国海岸16至56公里的一带。V-1飞弹的发射部队是1943年夏开始训练的，该部队称第155高炮团，共64个发射小分队。原计划在当年底就开始向英国发起攻击的，实际上推迟了将近半年。主要原因是V-1飞弹虽然投产并准备使用，但仍然存在技术、质量和装备跟不上等问题，加上盟军的轰炸和破坏，使德军的作战计划难以实施。直到1944年6月13日夜里德军V-1飞弹发射部队(第155高炮团)才发动了两次小齐射。第一波发射9枚飞弹，一枚也没有打到英国。第二波发射10枚飞弹，其中有5枚发射后不久就坠毁了，有1枚失踪，不知打到那里去了，剩下4枚打到了英国南部的潘斯卡门地区，有一枚击中了伯斯诺格林的住房，造成6人伤亡。
经过一天的调整和重新装备之后，从6月15日晚10时30分又开始对英国发射V-1导弹，在24小时内先后向伦敦发射了244枚，向南安普敦发射了50枚。后来发射V-1飞弹的总数量越来越多，到6月18日为第500枚，21日为第1000枚，29日为第2000枚，7月22日为第5000枚……
从1944年6月13日到9月4日，德军向英国东南部地区共发射了8600多枚V-1导弹，其中射向伦敦的约5000枚，但真正打到伦敦的不到一半。而且大多数飞弹造成的伤亡不大，只有少数飞弹打到了人口密集区才造成较严重伤亡和损失。特别是1944年6月8日上午11时20分，距白金汉宫仅400米的皇家近卫队教堂被击中，共有121名参加礼拜者被炸死。这是德军使用V-1飞弹作战，首次给对方造成重大伤亡，对伦敦市民造成巨大恐慌，有80至150万人被迫疏散。对美国政府也震动很大，6月18日艾森豪威尔要求盟军把对付V-1飞弹袭击放在仅次于地面战争的优先位置。
有军事家经估算后认为，若能使V-1飞弹的平均弹着点偏离9.6公里的话，每月就可减小12000人的伤亡。根据专家的建议，英国军方立即采取行动，通过特工人员(其中有被捕的德国特工人员)向德军提供“飞弹飞过了目标”的假情报，诱使其调整射程。这一招果然奏效，直到1944年07月21日，德军向伦敦发射的V-1飞弹，其平均弹着点基本上保持在泰晤士河以南，伦敦塔以南约72公里处。此后到10月份，其平均弹着点均在伦敦塔偏东南的6.4公里左右，从而减小了V-1飞弹对伦敦市造成的破坏和损失。德军之所以调整飞弹的射程，恐怕与它们当时缺少侦察机对所获得的情报进行核实有关。
9月1日以后，德军第155高炮团的飞弹发射阵地遭到盟军的攻击，而被迫撤退。从1944年9月4日起，德军将攻击重点转向欧洲大陆其它盟军目标。到1945年3月30日为止，共发射V-1飞弹近12000枚，其中向荷兰的安特卫普港发射约4900枚，向比利时的列日发射约3000枚，人员伤亡数以万计。V-1飞弹从地面发射，由于其阵地经常遭到盟军飞机轰炸和破坏，于是德军开始改进发射方式，改用轰炸机携带从空中发射。起初一架轰炸机只能带一枚V-1飞弹，在90公尺高度，以每小时257至273公里的速度飞向英国，在距海岸97公里轰炸机爬升到1000多公尺高度时，飞弹点火后从空中发射。轰炸机执行任务时，一般要有He-111战斗机为其护航。到1944年9月5日，德军先后从空中向英国境内发射了约400枚V-1飞弹。德军撤离法国后，直到战争结束时，德国对英国有威胁的攻击主要也是空中发射导弹。
限于当时的技术水准，从空中发射V-1飞弹，即使未被拦截，其命中精度也很低。在1944年7至9月，空射V-1飞弹的弹着点偏差在13公里到39公里范围内。12月24日。德军从空中向曼彻斯特发射了50枚V-1飞弹，仅有一枚打到了城内。1945年1月14日．德军最后一次从空中向英国发射了1200枚V-1飞弹，其中只有66枚打到了伦敦，其余均被英国飞机和地面火力所击落，还打掉了77架德国飞弹载机。
到了1945年3月，出现了V-1飞弹远程型。这种型别的飞弹与原型的V-1相比，主要是采用了其重量比金属弹翼轻了22.7公斤的木制弹翼，并减轻了弹头，使其射程增加到354公里。3月3日至29日，德军从荷兰向英国发射了275枚这种飞弹，结果只有13枚到了伦敦，而且大多数没有造成多大伤亡。只有3月8日，有一枚飞弹歪打正着，击中了伦敦市的史密斯菲尔德市场，造成伤亡233人。1945年3月28日，最后一枚V-1导弹落到了伦敦市的切尔斯哈托街，从此V-1飞弹再也没有在伦敦上空出现。为了垂死挣扎，最后德军还用V-1改装了150枚“人弹”(有人驾驶的自杀炸弹)称为Fil03/R3，交部队后称为V-4，但还未用上战争就结束了。
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