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    尿酸酶缺失大鼠肠道菌群的变化

    来源:六七范文网 时间:2023-06-17 23:25:03 点击:

    李 丹 ,万绪莲 ,李律宇 ,云 宇 ,罗光云 ,刘韦兵 ,林公府 ,李 宁 ,黎勇坤 ,段为钢

    (1)昆明医科大学基础医学院,云南 昆明 650500;2)云南中医药大学基础医学院,云南 昆明 650500;3)昆明市中医医院骨伤科,云南 昆明 650500;4)云南省第一人民医院骨科,云南 昆明 650100;5)广南县人民医院骨科,云南 文山 663300)

    高尿酸血症是危害人类健康的“第四高”,与痛风、高血压、糖尿病等常见病关系密切[1]。高尿酸血症的有效防治已经成为临床和实验研究的热点。虽然基于正常实验动物大小鼠,采用药物或食物建立高尿酸血症的模型层出不穷[2],但这些动物表达的尿酸酶则是贴近临床研究的障碍。近年来,尿酸酶缺失的大小鼠实验动物已经成功研制[3−4],但尿酸酶缺失后肠道菌群会发生什么改变一直未见系统报道。考虑到肠道也是尿酸排泄的重要途径,肠道菌群可能也具有一定的贡献[5−6]。本研究以同龄野生型大鼠为对照,系统观察尿酸酶缺失大鼠(Kunming-DY,KDY 大鼠)肠道和粪便菌群变化,为进一步研究KDY 大鼠血尿酸变化与肠道菌群的关系提供实验依据。

    1.1 材料

    雄性尿酸酶缺失大鼠,即KDY 大鼠由课题组前期采用CRISPR/Cas9 技术研制[4],45 d 日龄,按照SPF 标准饲养,自由进食饮水,环境温度(22±2)℃,模拟自然光照。对照鼠为雄性SPF 级SD 大鼠,45 d 日龄,由简阳达硕动物科技有限公司提供。

    尿酸检测试剂盒(磷钨酸法)购自南京建成生物工程研究所,全波长酶标仪(K6600A 型)由北京凯奥科技发展有限公司生成。其他试剂或仪器也均为国产。

    1.2 动物实验

    随机取6 只45 d 日龄雄性KDY 大鼠为尿酸酶缺失组(Uox-/-),随机取6 只45 d 日龄SD 大鼠为对照组(WT)。日龄45 d 时,称重,收集每只大鼠的新鲜粪便。随后乌拉坦(1 g/kg)麻醉大鼠,剪开腹腔,从腹主动脉取血制备血清。其中各组取3 只大鼠肠道(十二指肠到结肠末端),摊成110 cm(其中小肠90 cm,盲肠10 cm,结肠10 cm),每5 cm 取样于试管中。用干冰保存送样到上海生工生物工程(上海)有限公司提取DNA 进行16SrDNA 测序。

    1.3 尿酸测定

    血尿酸按照试剂盒说明书检测。

    1.4 菌群16SrDNA 高通量测序

    样品中的DNA 采用E.Z.N.A™ Mag-Bind Soil DNA Kit(OMEGA)试剂盒进行提取,采用Qubit3.0 DNA 检测试剂盒(Life)对提取的样品进行精确扩增,扩增引物选择原核生物V3~V4 引物(341F:CCTACGGGNGGCWGCAG 和805R:GACTACHVG GGTATCTAATCC 进行第1 轮扩增。随后加入Illumina 桥式PCR 兼容引物进行第2 轮扩增建立DNA文库进行高通量测序[7]。测序在数据分析上:采用QIIME 进行质控过滤掉不符合要求的DNA 序列,应用UPARSE 算法一致性水平达到97%以上的序列进行OTU 聚类,用UCLUST 分类法联网与SILVA数据库注释分析,采用R 语言分析群落组成分。在原核微生物类别上根据算法依次在门、纲、目、科和属水平进行归类并进行相对丰度(%)计算。

    1.5 统计学处理

    2.1 大鼠血尿酸和体重变化

    自由饮食状态下,正常野生型SD 大鼠的血尿酸约为11.77~14.69 µg/mL。尿酸酶缺失的KDY大鼠血尿酸水平显著升高到64.71~78.51 µg/mL之间,部分动物已经达到高尿酸血症的诊断标准(图1A)。尿酸酶缺失的KDY 大,鼠血尿酸水平显著升高,差异有统计学意义(P<0.05)。尿酸酶缺失后,比同龄雄性野生型SD 大鼠的体重明显减轻,即从250 g 减轻到170 g 左右,差异有统计学意义(P<0.05),见图1B。

    图1 KDY 大鼠的血尿酸水平和体重变化[(),n=6]Fig.1 Changes of blood uric acid level and body weight in KDY rats[(),n=6]

    2.2 KDY 大鼠肠道菌群变化

    从十二指肠开始,同龄KDY 大鼠各节段肠道的微生物分布在门(图2A)、纲(图2B)、目(图2C)、科(图2D)和属(图2E)水平与SD 大鼠均有明显不同。总体上看,KDY 大鼠各肠段的微生物多样性在门、纲、目、科以及属水平均呈下降趋势。有意思的是与SD 大鼠相比,KDY 大鼠各肠段乳酸菌属(Lactobacillus)(图2E)及相应的门(Firmicutes,厚壁菌门,图2A)、纲(Bacilli,芽孢杆菌纲,图2B)、目(Lactobacillales,乳杆菌目,图2C)、科(Lactobacillaceae,乳杆菌科,图2D)的丰度也增高。

    图2 KDY 大鼠各肠段菌群丰度变化[(),n=6]Fig.2 Variation of flora abundance in each intestinal segment of KDY rats[(),n=6]

    在属水平统计细菌种类数,发现野生型SD大鼠的细菌种类数波动较大。与野生型SD 大鼠相比,KDY 大鼠各肠段菌群多样性总体上具有减少趋势,其中第9 肠段的菌群种类明显减少,差异有统计学意义(P<0.05),见图3。

    图3 KDY 大鼠各节段菌群属水平多样性变化Fig.3 Variation of microflora at genus level in each segment of KDY rats

    2.3 大鼠粪便菌群变化

    同龄KDY 大鼠新鲜粪便微生物分布在门(图4A)、纲(图4B)、目(图4C)、科(图4D)和属(图4E)水平均有明显不同。与肠道菌群变化不同的是,KDY 大鼠粪便中的微生物多样性呈现增加趋势。从属水平(图4E)看,与SD 大鼠相比,KDY 大鼠新鲜粪便克罗诺菌属(Cronobacter)丰度明显减少,差异有统计学意义(P<0.05)。乳杆菌属(Lactobacillus)丰度明显增加,这一点与各肠段的数据一致。

    与肠道内菌群不同的是,野生型SD 大鼠和KDY 大鼠粪便中的克罗诺杆菌属(Cronobacter,图4E)丰度均较乳酸杆菌增加,差异有统计学意义(P<0.05)。其所在的门(Proteobacteria,变形菌门,图4A)纲(Gammaproteobacteria,γ-变形菌纲,图4B)目(Enterobacteriales,肠杆菌目,图4C)科(Enterobacteriaceae,肠杆菌科,图4D)的丰度也增高,差异有统计学意义(P<0.05)。

    图4 KDY 大鼠新鲜粪便菌群丰度变化Fig.4 Abundance changes of fresh fecal flora in KDY rats

    从物种多样性看,野生型SD 大鼠与KDY 大鼠新鲜粪便在门、纲、目、科和属水平上相比均无明显差异(P>0.05),见图5。

    图5 KDY 大鼠新鲜粪便不同水平的种类差异Fig.5 Species differences of fresh feces in KDY rats at different levels

    2.4 乳酸杆菌属丰度变化

    在属水平,不管是在野生型SD 大鼠还是KDY 大鼠,乳酸杆菌属(Lactobacillus)是各段肠中丰度最高的菌属。特别地,KDY 大鼠各肠段乳酸杆菌均处于较高丰度水平,只有在结肠以及粪便中才锐减(可能与乳酸杆菌厌氧有关),但也较野生型SD 大鼠高,差异有统计学意义(P<0.05),见图6。

    图6 乳酸杆菌属(Lactobacillus)在各段肠及粪便中的变化趋势Fig.6 Change trend of lactobacillus in intestinal tract and feces

    尿酸酶缺失KDY 大鼠的成功研制为研究高尿酸血症、痛风及相关疾病提供了较理想的模型动物[7−12]。雄性KDY 大鼠血尿酸水平远高于野生型SD 大鼠,其血尿酸水平在50~80 µg/mL 之间,与成年男性的血尿酸水平接近[4,12],但远低于文献报道的尿酸酶缺失小鼠[3]。该大鼠断奶后的1 a 生存率达90%以上[4],因此KDY 大鼠可用于高尿酸血症、痛风及相关疾病的长期研究。

    本研究发现尿酸酶缺失后,各肠段的菌群多样性有下降趋势,且小肠中段(第9 段,相当于空肠和回肠交界处)菌群多样性下降具有统计学差异。不同的是,KDY 大鼠新鲜粪便中的菌群多样性却基本一致,尽管某些菌群的丰度发生了较大改变。

    尿液和粪便是尿酸排泄的两个主要途径,一般认为前者约占2/3,后者约占1/3。笔者用KDY 大鼠证实,正常KDY 大鼠的尿液尿酸排泄约占90%,粪便尿酸排泄约占10%[12],这说明正常情况下肠道尿酸排泄的地位远低于肾脏。特别地,肠道菌群与血尿酸水平的关系尚不明确。考虑到很多细菌表达尿酸酶,寄生在肠道的细菌可能参与尿酸降解代谢,因此有人认为肠道菌群可能有利于血尿酸降低[5−6]。然而笔者前期用雄性KDY 大鼠证明:KDY 大鼠的新鲜粪便含有更多的细菌,且用抗菌药物抑制肠道细菌后血尿酸水平也未发生明显变化[13],这似乎说明肠道菌群可能不是影响血尿酸的主要因素(高表达尿酸酶的基因工程菌除外)。

    由于肠道中真菌的丰度极低,本研究只较系统地用16SrDNA 测序技术研究了雄性KDY 大鼠的各肠段的细菌变化。从整体上看,KDY 大鼠各肠段菌属有减少的趋势,但乳酸菌属的丰度却总体上高于野生型SD 大鼠。考虑到,大多数乳酸菌属于益生菌,该菌属的增加可能有利于维持KDY 大鼠的肠道健康[14],从而降低其他致病菌或条件致病菌如假单胞菌(Pseudomonas)、支原体(Mycoplasma)、棒状杆菌(Corynebacterium)、不动杆菌(Acinetobacter)、链球菌(Streptococcus)、草螺菌(Herbaspirillum)、梭菌(Clostridiales)、罗思氏菌属(Rothia)和螺杆菌(Helicobacter)的丰度,继而可能有助于对抗尿酸酶缺失后的肠道损伤[15]。且KDY 大鼠肠液的尿酸水平远高于野生型SD 大鼠[12,15],这种现象可能与高尿酸环境有利于乳酸菌属生存有关。

    总之,与野生型SD 大鼠相比,KDY 大鼠肠道和粪便菌群发生了较大变化,在肠道菌群多样性有所减少的趋势下整体增加了乳酸菌的丰度。

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