一、选地
选择透气和排灌水良好、富含有机质、pH值在6.5左右的壤土为宜。有机柑橘生产必须选择与非有机生产园区具有清楚、明确的界限和缓冲带的地块，以防止禁用物质污染，田块的空气质量要达到《环境空气质量标准》（GB 3095-1996）中所规定的一级标准。
二、施肥
有机柑橘生产要求生产者不能使用任何化肥或化学复合肥，必须通过间作、覆盖及施用有机肥来增加或维护作物养分，提高土壤肥力，减少侵蚀，增加土壤有机质含量和生物活性。但必须保证柑橘作物、土壤或水不被植物营养物质、致病病原体、重金属、污水污染。如果上述措施不能满足柑橘生长的营养需求，或不足以保持土壤肥力，生产者可以施入土壤改良调节剂、有机或溶解性高的矿物质。注意其中某些肥料的应用必须得到有资质资格的检查机构的认可。
1. 施肥种类
有机肥，指经过无公害化处理的堆肥、沤肥、厩肥、沼气肥、绿肥、饼肥及有机柑橘专用肥。但有机肥料的污染物质含量应符合规定，并经有机认证机构的认证。
矿物源肥料、微量元素肥料和微生物肥料，只能作为培肥土壤的辅助材料。微量元素肥料在确认柑橘树有潜在缺素危险时作叶面肥喷施。微生物肥料应是非基因工程产物，并符合《微生物肥料行业标准》NY 227的要求。禁止使用化学肥料和含有毒、有害物质的城市垃圾、污泥和其他物质等。
2. 施肥方法
2月底至3月初、5月上旬、6月下旬至7月上旬，在柑橘树冠滴水线下开环状沟（沟深15厘米左右），每株浇施腐熟后的有机肥10公斤或柑橘专用有机肥2.5～5公斤。9月中下旬在柑橘树冠滴水线下开环状沟（沟深20厘米），每株施入腐熟的农家肥10公斤。每次施肥后覆土。
3. 叶面施肥
叶面肥根据柑橘树体的生长情况合理施用，使用的叶面肥必须在农业部登记注册，并获得有机认证机构的认证，叶面肥在采果前10天停止使用。
三、病虫草害防治
遵循防重于治的原则，从整个柑橘园区生态系统出发，以农业防治为基础，综合运用物理防治和生物防治措施，创造不利于病虫草害发生但有利于各类天敌繁衍的环境条件，增进生物多样性，保持柑橘园区内生物平衡，减少各类病虫草害所造成的损失。
1. 加强农业技术措施
种植防护林。选择速生且与柑橘无共生病虫的树种；选用抗病砧木，如枳、枳橙等；园内可进行间作和生草栽培，选择浅根、矮秆、与柑橘无共生性病虫的豆科作物，浅根性蔬菜和禾本科牧草；加强栽培管理，如翻土、排水、修剪、清园等，减少病虫源，增强树势，提高柑橘树体的抗病虫能力。
2. 物理机械防治措施
应用灯光防治害虫，如用黑光灯诱杀金龟子、卷叶蛾等；利用黄色荧光灯诱杀吸果夜蛾等。利用害虫的趋化性防治害虫，如在糖醋液中加农药诱杀柑橘小实蝇、拟小黄卷叶蛾等；可用黄板诱杀蚜虫。
3. 生物防治技术措施
保护和利用当地柑橘园中的草蛉、瓢虫和寄生蜂等天敌昆虫，以及蛙类、蜘蛛和鸟类等有益生物，减少人为因素对天敌的伤害；引入和繁殖病虫害天敌和寄生者，如人工引进放养捕食螨防治落叶蜘蛛，澳洲瓢虫防治吹绵蚧等；保护和扩大天敌的栖息地（行间种植绿肥作物或牧草等）；允许使用生物源农药，如微生物源农药——苏云金杆菌（BT）、植物源农药——苦烟水剂和矿物源农药。
4. 杂草控制
柑橘园区采用树盘清耕、行间生草栽植技术，当树盘内出现杂草或行间杂草高度超过20厘米时，应采用割草、人工锄草等方法，或用未经有毒有害物质污染的作物秸秆、塑料薄膜等其他合成材料覆盖，但这些覆盖材料必须在柑橘果实收获之后从园区移走。
注意：禁止使用混配的化学合成的杀虫剂、杀菌剂、杀螨剂、除草剂和植物生长调节剂；植物源农药宜在病虫害大量发生时使用；矿物源农药应严格控制在非采果季节使用。
四、土壤管理
1. 定期监测土壤肥力水平和重金属元素含量，一般要求每2年检测1次。根据检测结果，有针对性地采取土壤改良措施。
2. 采用地面覆盖等措施提高柑橘园的保土蓄水能力。将未结籽的杂草和作物秸秆作为覆盖物，外来覆盖材料应未受有害或有毒物质的污染。
3. 采取合理耕作、多施有机肥等方法改良土壤结构。耕作时应考虑当地降水条件，防止水土流失。
4. 提倡放养和使用有益微生物等生物措施改善土壤的理化和生物性状，但微生物不能是基因工程产品。
5. pH值低于5.5 的柑橘园可用白云石粉等矿物质调节土壤pH值，而pH高于7.5的柑橘园可使用硫磺粉调节土壤pH值至5.5～7.5 的适宜范围。
6. 行间的间作物或种植的绿肥植物，要求一年生树龄行间间作物距柑橘树1米以上，二年生园区1.5米以上，三年生园区2米以上。间作物种类包括豆科类的葫豆、大豆、花生和用作绿肥或饲料的牧草。间作物必须按照有机农业的管理办法进行管理。
五、柑橘园区的排水与灌溉
1. 柑橘园区的排水
对大田上建造的柑橘园，必须管理好排水沟，以保证在多雨季节不积水烂根。排水沟要求上宽下窄，且深度达到80厘米以上。
2. 柑橘园区的灌溉
在干旱季节须灌水，以保证树体生长的需求，灌溉的水质必须无污染。有机柑橘果园灌溉水质标准项目浓度限值：pH值5.5～7.5，总汞（毫克/公斤）≤0.001，总镉（毫克/公斤）≤0.005，总砷（毫克/公斤）≤0.05，总铅（毫克/公斤）≤0.1。
六、柑橘园区的清园
将园区内所有的枯枝、落叶、修剪的病虫枝及杂草，集中进行无害化处理，减轻病虫草的越夏越冬基数，保持园区清洁。