“十五”以来，全院共有63个新品种通过国家审（认）定，349个新品种通过省级审（认）定，10个品种获国家后补助，12个品种获得国家植物新品种权。
2006~2008年国家审（鉴、认）定品种（29个）
大豆：晋豆34、汾豆56、汾豆60、汾豆65、汾豆72，山西农科院经作所育成；晋遗31，山西农科院作物所育成。
高粱：晋草2号、草3号、泸糯9号，山西省农科院高粱所育成。
葵花：YS809，山西省农科院棉花所育成。
黍子：雁黍8号，山西省农科院高寒所育成。
小麦：晋麦79号、临旱6号，山西省农科院小麦所育成；长4738、长6359，山西省农科院谷子所育成；太10604、晋太170，山西农科院作物所育成。
谷子：长农36号、长0301，山西省农科院谷子所育成；汾选4号，山西农科院经作所育成；晋谷34号、晋谷36号、晋谷41号、谷42号，山西农科院作物所育成。
玉米：强盛11号、强盛青贮30，山西省农科院食用菌所育成。
甘蓝：惠丰4号、惠丰5号，山西省农科院蔬菜所育成。
稻子：晋稻8号，山西农科院作物所育成。
2006年山西省审（认）定品种（43＋16个）
玉米：并单6号（极早单13号）、并单5号、晋阳1号（太选2371），山西省农科院作物所育成；强盛16号、强盛101号、强盛28号（强试2-8号），山西强盛种业有限公司育成；同单38号，山西省农科院高寒所育成；忻黄单156（忻单156），山西省农科院玉米所育成；临玉2号（隰玉845），山西省农科院隰县试验站育成；长玉18，山西省农科院谷子所育成；大丰3号、大丰14号，山西大丰种业有限公司育成；长玉19（长玉试04-4），山西省农科院谷子所育成；临玉3号，山西省农科院小麦所育成；品玉1号，山西省农科院农作物品资所育成；长单43，山西省农科院谷子所育成；腾糯1号（糯玉527），山西腾达种业有限公司育成。
棉花：DH966，山西省农科院作物所育成；杂208、晋棉45号（99A-44）、晋棉46号（科能0316）、晋棉44号（2001pb-3），山西省农科院研究所育成。
向日葵：同葵杂1号，山西省农科院高寒所育成；晋葵8号（汾葵杂13号），山西省农科院经作所育成。
油菜：高油9号，山西省农科院高寒所育成。
大豆：长豆003、长豆001，山西省农科院谷子所育成。
马铃薯：晋薯15号（同薯15号），山西省农科院高寒所育成。
西瓜：晋早蜜1号，山西省农科院蔬菜所育成；晋抗早冠、晋抗4号，山西省农科院园艺所育成；强农2号、强农3号，山西强盛种业有限公司育成；甜霸1号，山西省农科院高粱所育成。
小麦：运麦218（运麦85218），山西省农科院棉花所育成；晋麦78号（临旱538）、晋麦79号（临旱51241）、晋麦80号（临抗4036）、晋麦81号（RI-11），山西省农科院小麦究所育成；晋太170，山西省农科院作物所育成；汾4846、汾4439，山西省农科院经济作物所育成。
水稻：晋稻10号（990162），山西省农科院作物所育成。
↑以上为审定品种
谷子：晋谷39号（大同28号），山西省农科院高寒所育成；长谷4号（长1658），山西省农科院谷子所育成；晋品谷1号，山西省农科院品种资源所育成；长生04，山西省农科院谷子所育成；晋谷40号（2012），山西省农科院经济作物所育成。
红小豆：晋小豆2号（汾红小豆1号），山西省农科院经济作物所育成。
荞麦：晋荞麦（甜）3号（BI-1），山西省农科院小杂粮中心育成。
甘薯：晋甘薯5号（运2188），山西省农科院棉花所育成。
燕麦：晋燕12号（8914），山西省农科院高寒作物所育成。
花生：晋花5号（临花00-16），山西省农科院小麦所育成。
番茄：品番茄1号，山西省农科院品种资源所育成。
西葫芦：晋西葫芦4号（长青1号），山西省农科院蔬菜所育成；翠青306（306），山西强盛种业有限公司育成。
桃：临桃1号，山西省农科院小麦所育成。
樱桃：龙田晚红（WR-2）、YT101苹果树矮化砧木，山西省现代农业研究中心育成。
2007年山西省审（认）定品种（40＋13个）
玉米：品玉8号（品特早1号），山西省农科院品资所育成；晋单53号（忻62163）、晋单54号（忻单226），山西省农科院玉米所育成；潞玉5号（长玉试04-2）、长玉16（长玉试04-1），山西省农科院谷子究所育成；临单15号，山西省农科院小麦所育成；晋单55号（龙田2号），山西现代农业研究中心育成；强盛51号（强051），山西强盛种业有限公司育成；晋单56号（运单26号）山西省农科院棉花究所育成；大丰20号，山西大丰种业有限公司育成；忻糯5号（忻5002糯），山西省农科院玉米研究所育成；晋农科1号（并单12号），山西省农科院作物遗传研究所育成。
棉花：晋棉49号（运B69）、运彩3738、运彩绿-1，山西省农科院棉花所育成；棕杂1号，山西省农科院作物所育成。
大豆：汾豆72号，山西省农科院经济作物所；晋豆35号（同豆H319），山西省农科院高寒所育成。
马铃薯：晋薯16号（同薯19号）、晋薯17号（同薯21号），山西省农科院高寒所育成。
西瓜：强农5号，山西省农科院食用菌所育成。
谷子：晋谷42号（太选3号），山西省农科院作物所育成；长谷1号、长农0302、长农38号、长生18，山西省农科院谷子所育成。
红小豆：晋小豆3号（晋红2号），山西省农科院小杂粮中心育成。
黍子：晋黍8号（8760），山西省农科院高寒所育成。
荞麦：晋荞麦（苦）4号（J2-8），山西省农科院小杂粮中心育成。
甘薯：晋甘薯6号（临薯1号），山西省农科院小麦所育成。
芝麻：晋芝4号（汾芝5号），山西省农科院经济作物所育成；晋芝5号（临芝5号），山西省农科院小麦所育成。
蓖麻：晋蓖麻5号（先锋5号），山西省农科院作物所育成。
小麦：临汾8050、绿丰2号（RI-14）、临汾6510，山西省农科院小麦所育成；舜麦1718、运旱20410，山西省农科院棉花所育成；长麦6686（长治02-6686）、长7016，山西省农科院谷子所育成。
↑以上为审定品种
番茄：欧美红抗帝王，山西省农科院生物中心育成；艳粉302（302）山西省农科院食用菌所育成。
西葫芦：早丰一代，山西省农科院蔬菜所育成；冬青，山西省农科院品种资源所育成；长青王4号，山西省农科院棉花所育成。
南瓜：红栗、青栗，山西省农科院园艺所育成。
芸豆：矮生无丝豆，山西省农科院综考所育成。
芹菜：晋芹2号（芹美1号），山西省农科院蔬菜所育成。
梨：晋巴梨，山西省农科院生物中心育成。
桃：龙田早蟠，山西省现代农业研究中心育成。
苹果：龙田早嘎，山西省现代农业研究中心育成。
葡萄：秋红宝，山西省农科院果树所育成。
2008年山西省审（认）定品种（28＋27个）
玉米：并单4号，山西省农科院作物所育成；晋单57号（忻试8002），山西省农科院玉米所育成；丰禾96，山西丰禾种业有限公司育成；晋单58号（汾单171），山西省农科院经济作物所育成；长单48号（长试041），山西省农科院谷子所育成；晋单62号（先锋3号），山西省农科院作物所育成；晋单63号（临玉6号），山西省农科院小麦所育成；晋单64号（运单29号），山西省农科院棉花所育成；晋糯8号（晋鲜糯8号）、忻糯301（忻3001），山西省农科院玉米所育成；晋饲育1号，山西省农科院品种资源所育成。
棉花：太270（T270），山西省农科院作物所育成；晋棉50号（SX02），山西省农科院棉花所等育成。
大豆：长豆006，山西省农科院谷子所育成；晋豆37号（临豆0179），山西省农科院小麦所育成；晋豆（鲜食）38号（忻毛豆2号），山西省农科院玉米所育成；晋豆（鲜食）39号（汾豆77号），山西省农科院经济作物所育成。
马铃薯：晋薯18号（同薯24号），山西省农科院高寒所育成。
西瓜：农丰4号，山西省农科院生物中心育成。
小麦：晋麦84号（运麦494）、舜麦612（旱优61），山西省农科院棉花所育成；晋麦85号（临旱6207），山西省农科院小麦所育成；晋太9923，山西省农科院作物所育成；晋麦86号（汾4858），山西省农科院经济作物所育成；太5902（太原5902），山西省农科院作物所育成；长麦6135，山西省农科院谷子所育成。
大麦：晋大麦[啤]1号（晋审大麦），山西省农科院小杂粮中心育成；晋大麦[啤]2号（临啤2号），山西省农科院小麦所育成。
↑以上为审定品种
谷子：晋谷43号（大同29号），山西省农科院高寒所育成；晋谷44号（汾选6号），山西省农科院经济作物所育成；长杂2号，山西省农科院谷子所育成。
高粱：晋杂22号（晋中05-1）、晋杂23号（晋中05-2）、晋杂24号（晋杂05-1），山西省农科院高粱所育成。
甘薯：晋甘薯7号（临薯2号），山西省农科院小麦所育成。
苜蓿：同引苜蓿1号（同引1号）、同引苜蓿2号（同引2号），山西省农科院高寒所育成。
花生：兴花1号，山西省农科院经济作物所育成。
番茄：晋番茄6号（保丰1号），山西省农科院蔬菜所育成；艳红2号，山西强盛种业有限公司育成。
辣椒：盛椒11号，山西强盛种业有限公司育成；品椒8号，山西省农科院品种资源所育成。
西葫芦：东葫2号、东葫3号，山西省农科院棉花所育成；欧美圣玉，山西省农科院生物中心育成；晋园6号，山西省农科院园艺所育成。
韭菜：晋韭1号（临韭2号），山西省农科院小麦所育成。
白菜：新绿70、科萌78，山西省农科院蔬菜所育成。
苹果：新凉香，山西省农科院果树所育成。
葡萄：早康宝无核，山西省农科院果树所育成。
梨：阿巴特梨，山西省农科院果树所育成。
核桃：金薄香7号、金薄香8号，山西省农科院果树所育成。
樱桃：晶玲，山西省农科院果树所育成。