赣南医学院第一附属医院中医科在两院区均设有中医普通门诊和专家门诊，包括：中西医结合失眠、中西医结合肝胆病、中西医结合脾胃病、中西医结合男科、中医肿瘤、中医针灸埋线、中医推拿按摩等多个特色专科门诊。主要优势病种包括：睡眠障碍、肿瘤、肥胖、慢性肝胆疾病（慢性乙肝、慢性胆囊炎、肝硬化等）、功能性消化疾病（消化不良、便秘、慢性胃炎、慢性肠炎等）、急慢性乳腺炎、突发性耳鸣耳聋、中风后遗症、颈肩腰腿痛、过敏性疾病（过敏性鼻炎、过敏性咳嗽、急慢性荨麻疹等）男科疾病（阳痿早泄、男性不育症、男性更年期综合征、慢性前列腺炎等）、月经病、女性不孕症、儿科常见病（小儿外感病、积食、厌食等）、亚健康状态等，年门诊量 23 000 多人次。
中医科住院部设于章贡院区，有核定病床 18 张，病房以中西医结合诊治失眠（不寐）、功能性胃肠疾病、中风后遗症、颈肩腰腿痛、肿瘤、突发性耳鸣耳聋等常见慢性病为主。
经过数十年孜孜不倦地追求和努力，赣南医学院第一附属医院中医科逐步建成为“临床业务精湛、教学水平先进、科研能力稳步提升”的综合性科室，是一支基于传统、勇于创新、充满朝气的医疗团队，以治疗疾病、解除痛苦为使命，担负着赣南苏区千万人民中医药治疗和保健服务工作。
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